Γ' γύρος : ΑΕΛ - Απόλλων Αθηνών 2-0
28 Δεκεμβρίου 1988
Σκόρερς: 53' Βαλαώρας, 71' Μητσιμπόνας
ΑΕΛ (Βλαντιμίρ Ταμπόρσκι): Μιχαήλ, Παπαντωνίου, Κυριλίδης, Γκαλίτσιος, Μητσιμπόνας, Αλεξούλης, Αθανασίου, Αγορογιάννης (46' Τσιώλης), Ζιώγας, Τσιλιάκος (80' Κανιέμπα), Βαλαώρας.
Διαιτητής: Νίκος Φιλιππιάδης (Θεσσαλονίκης)
Γήπεδο: Αλκαζάρ
Εισιτήρια: 4700
Εισπράξεις: 2.126.450 δρχ.
Η ΑΕΛ θέλησε να εξασφαλίσει την πρόκριση στην επόμενη φάση του κυπέλλου με ευρύ σκορ, αλλα ο τερματοφύλακας του Απόλλωνα Κουρκούνας, ήταν σε πολύ καλή μέρα κι έτσι η ΑΕΛ αρκέστηκε να κουβαλήσει στον επαναλληπτικό αγώνα το φτωχό 2-0.
Κύπελλο Ελλάδος 1988-89
Στην 47η διοργάνωση του κυπέλλου Ελλάδας 1988-89 μετείχαν συνολικά 52 ομάδες (16 Α' εθνικής, 18 Β' εθνικής και 18 Γ' εθνικής κατηγορίας) και διεξήχθη σε 6 γύρους, συμπεριλαμβανομένου του τελικού.
Τη χρονιά αυτή καθιερώθηκε για πρώτη φορά η φάση των προκριματικών ομίλων στον Α' γύρο, με τις ομάδες της Α' εθνικής να τίθενται επικεφαλής των ομίλων οι οποίοι συμπληρώνονται από ομάδες μικρότερων κατηγοριών και την πρόκριση να κερδίζουν οι δύο πρώτες ομάδες της κατάταξης. Η έμπνευση γι αυτή τη διαδικασία πάρθηκε από το κύπελλο Ιταλίας και κύριος στόχος της ήταν το να έχουν οι ομάδες κάποιους επίσημους αγώνες πριν την έναρξη των πρωταθλημάτων και των κυπέλλων Ευρώπης.
Με διάφορες μορφές η αρχική φάση των ομίλων έλαβε χώρα συνολικά σε 11 διοργανώσεις, με τελευταία της περιόδου 2001-02. Η μοναδική ομάδα Α' εθνικής που αποκλείστηκε τη χρονιά αυτή από τη φάση των ομίλων, ήταν η Δόξα Δράμας.
Η διοργάνωση στη συνέχεια σημαδεύτηκε από πολύ επεισοδιακούς αγώνες και παρατράγουδα, αρχικά στο Β' γύρο και μετά τον αποκλεισμό του Ολυμπιακού από τον ΟΦΗ και της ΑΕΚ από τον Λεβαδειακό, αλλά κυρίως στην προημιτελική φάση, όταν με τη σειρά του ο ΟΦΗ αποκλείστηκε από τη Λάρισα, καθώς επακολούθησε σύρραξη στο γήπεδο του ΟΦΗ μετά το τέλος του επαναληπτικού αγώνα από τους ποδοσφαιριστές των 2 ομάδων. Μικρότερης έντασης επεισόδια υπήρξαν στην ίδια φάση και μετά τη λήξη της παράτασης του αγώνα Πανιωνίου - ΠΑΟΚ.
Στον τελικό έφτασαν ο Παναθηναϊκός και ο Πανιώνιος, αντίπαλοι ξανά σε τελικό μετά από 22 χρόνια. Ο Παναθηναϊκός στο δρόμο προς τον τελικό μετά τη φάση των ομίλων απέκλεισε διαδοχικά τους Ολυμπιακό Βόλου, Παναχαϊκή, ΠΑΣ Γιάννινα και Εθνικό, ενώ ο Πανιώνιος απέκλεισε αντίστοιχα τους Σπάρτη, Άρη, ΠΑΟΚ και Λάρισα. Στον τελικό οι "πράσινοι" επανέλαβαν την επιτυχία του 1967 νικώντας αυτή τη φορά με σκορ 3-1. Τηλεοπτικά μεταδόθηκαν μόνο τα τελευταία 30 λεπτά του τελικού λόγω της αιφνιδιαστικής στάσης εργασίας των υπαλλήλων της ΕΡΤ η οποία και διεκόπη κατόπιν απαίτησης των τηλεθεατών. Για δεύτερη συνεχόμενη χρονιά πρώτος σκόρερ της διοργάνωσης αναδείχθηκε ο Δημήτρης Σαραβάκος που πέτυχε 7 γκολ.
Οι αγώνες της ΑΕΛ στο θεσμό του κυπέλλου:
Φάση ομίλων : 21/8/1988 : ΑΕΛ - Νίκη Βόλου 0-0
Φάση ομίλων : 28/8/1988 : ΑΕΛ - Πιερικός 3-1
Φάση ομίλων : 4/9/1988 : Καλλιθέα - ΑΕΛ 0-1
Βαθμολογία 4ου ομίλου:
1. ΑΕΛ 5
2. Νίκη Βόλου 3
3. Καλλιθέα 2
4. Πιερικός 2
Β' γύρος : 30/11/1988 : ΑΕΛ - Νίκη Βόλου 4-0
Β' γύρος : 14/12/1988 : Νίκη Βόλου - ΑΕΛ 0-1
Γ' γύρος : 28/12/1988 : ΑΕΛ - Απόλλων Αθηνών 2-0
Γ' γύρος : 11/1/1989 : Απόλλων Αθηνών - ΑΕΛ 0-0
Προημιτελική φάση : 1/2/1989 : ΑΕΛ - ΟΦΗ 2-1
Προημιτελική φάση : 15/2/1989 : ΟΦΗ - ΑΕΛ 1-1
Ημιτελική φάση : 22/3/1989 : Πανιώνιος - ΑΕΛ 2-0
Ημιτελική φάση : 12/4/1989 : ΑΕΛ - Πανιώνιος 0-0
